Correspondem a iniciativas de professores do Instituto, de base física ou virtual, para congregar projetos de pesquisa científica e/ou tecnológica em grupos com identificação própria perante a comunidade. Tais Laboratórios não têm existência jurídica própria. Dentre as iniciativas ora organizadas, estão o Laboratório de Tempo Real e Sistemas Embarcados, cujas áreas de pesquisa incluem sistemas de tempo real, sistemas energeticamente eficientes, sistemas embarcados, redes de sensores, computação móvel e sistemas ubíquos; Projeto Sinergia; Language-driven Software Engineering Research Group, com interesse em métodos formais, linguagens de programação e engenharia de software; Lab ESI, onde são desenvolvidas pesquisas relacionadas a arquitetura e gerência de configuração de software, interação homem-computador, linguagens de programação, sistemas multi-agente e agentes de software, e os Laboratórios MediaLab e VisualLab que atuam nas linhas de pesquisa de Computação Visual, Visualização de Dados, Processamento de Imagens e Computação Gráfica.